在SFC发售的时候，马里奥周边同样达到了火爆的程度，T恤、抱枕、漫画、手办等任何可以想象到的东西都变成了炙手可热的商品，这样的成功也让任天堂在《超级马里奥世界》沿着进化和创新的道路不断前行，赋予《超级马里奥世界》更多的惊喜，除了火焰花、蘑菇外，这次马里奥还可以变身披着披风的勇士在空中飞翔。
最重要的是《超级马里奥世界》带来一个全新角色一一耀西，它是一只可以被马里奥骑乘的萌宠一一可爱的绿色小恐龙。使用耀西的能力，马里奥可以用不同的方式和游戏有更新奇的互动。比如耀西的长舌头可以轻松的吃掉库巴大王的喽啰们，甚至还可以在吃掉特定的敌人后拥有全新的技能。
《超级马里奥世界》沿用了《超级马里奥兄弟3》的大地图系统，但是这一次不仅可以在大地图存档，还可以发掘出很多隐藏要素。这种设定鼓励玩家们在同一个关卡中反复寻找隐藏出口，从而得到特殊道具或开启新的关卡，使得游戏自身除了优秀的素质外更加入多元化的元素，更耐玩、更有趣。
《超级马里奥世界》的出现可以说是至关重要的，因为那个时代已经不是任天堂一家独大了，世嘉开始挑战任天堂的霸主地位。不仅是索尼克，SEGA MASTER SYSTEM同样拥有过硬的性能和优秀的作品，如果任天堂不展现出更强的实力，那么霸主的宝座很有可能被世嘉抢走。幸运的是，SFC的成功让任天堂牢牢的占据了这个位子。
在《超级马里奥世界》获得巨大的成功后，任天堂开始思考下一步的作品，最后决定扩展被玩家喜爱的耀西的成为主角可能性。耀西的抢眼表现让玩家们对它非常喜爱，于是任天堂着手给这个角色开辟一个新的系列。
1995年，《超级马里奥世界2：耀西岛》诞生了！令人惊讶的是，FC，马里奥系列的玩法被彻底颠覆，马里奥不再是主角，相反的，玩家要操纵耀西从宝宝库巴大王手中拯救宝宝马里奥和宝宝路易基。
《超级马里奥世界2：耀西岛》的发售远不止是给马里奥系列打造一个周边作品那么简单，这款游戏证明了任天堂对一个商标可塑性的发掘达到了不可思议的地步。马里奥系列从来没有固步自封，而是一直在变革创新。
1996年，Nintendo 64发售了，巨大的硬件升级给游戏带来了新的玩法，放弃了传统的2D卷轴风格，任天堂开始制作一部革命性的作品，最终《马里奥64》诞生了。
游戏的标题没有按常理出牌，游戏本身也是如此。告别了传统的2D画面，《马里奥64》把更逼真生动的3D游戏概念展示给玩家。从此，马里奥也不再局限在平面，全新的3D建模也让他变得活灵活现，玩家可以从不同的角度去欣赏游戏中的每一个角色。
任天堂首次3D游戏的尝试给业界带来了巨大的影响，一些从未有过的设计让当时的世嘉都震撼不已。Nintendo 64的C摇杆向世界展示了在全3D世界中如何解决视角问题，即使到了今天，大多数的3D游戏依然沿用类似C摇杆的设计，可见任天堂的决策多么高瞻远瞩。
还有个特别的事情，虽然在业界不是大事，但对马里奥来说却值得记录。在《马里奥64》中，马里奥有了自己的配音演员一一Charles Martine，这位大叔至今也在为马里奥配音。声优的加入使马里奥更加的完整，也让玩家们有机会去发觉马里奥更多的人格魅力。
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