原来在初代《魂斗罗》故事发生的六年前，人类在木星上发现了“莫伊拉遗迹”。这是一个由高级文明所留下的物品，其出现年代比人类诞生还早，且科技水平远超人类。“元老院”偷偷将“莫伊拉遗迹”带回地球研究，却由此触发了遗迹的保护程序。四年后陨石落入加鲁加群岛，保护程序不断产生新的异形，准备向地球人发动进攻，夺回被夺走的遗迹。
原来以为在《魂斗罗》与《超级魂斗罗》是扮演拯救人类的英雄，其实不过是助纣为孽而已。为了救赎，兰斯选择了加入异形，成为“红色猎鹰”的一份子，最终死在战友的面前;为了救赎，比尔选择再次扮演英雄，击败真正的敌人——反被“莫伊拉遗迹”控制的政府首脑“元老院”。
《真魂斗罗》通过比尔与兰斯的结局，揭示出“魂斗罗”系列永恒不变的英雄主题——曾经的英雄，与强力组织的纠葛，被遗忘的结局。无论游戏内外，时间先后，这一主题被“魂斗罗”系列一再上演。
■ 巴哈姆特：英雄前的英雄
比尔和兰斯，通常被认为是“魂斗罗”的代名词，也是最早获得这个称号的人。然而在整个系列的历史中，有一个人早在两人之前，就被公认为是配得上“魂斗罗”称号的英雄。这个人最终的结局，同样令人唏嘘。
2011年，在PSN和XBLA上推出过这样一款横版射击游戏——《铁血兵团：反叛》。这部游戏虽然没有冠以“魂斗罗”的名字，但从游戏系统和关卡设计上，无不显示其与“魂斗罗”的密切关系。曾经制作过《罪恶装备》的Arc System Works，在这部作品里向玩家展现了早在比尔和兰斯之前，一个真正的“魂斗罗”战士是如何成长起来的。
《铁血兵团：反叛》的故事发生初代《魂斗罗》的二十年前，那时候木星上的“莫伊拉遗迹”还没有被人发现，地球上有一个由皇帝统治的联邦大帝国。年轻的敢死队精英战士巴哈姆特上校，无法忍受残酷镇压与人性冲突的煎熬，终于在枪口对准无辜儿童的时候爆发，叛逃出帝国军队，加入曾经被他打败的反抗军。巴哈姆特利用自己高超的游击战术技巧，对抗帝国的领土扩张行动。在他的身边，四名精英战士组成了最初的“魂斗罗”兵团。讽刺的是，这种由巴哈姆特亲手组建的兵团模式，最终成了他的命运的归宿。
在比尔和兰斯之前，巴哈姆特是当之无愧的“魂斗罗”战士，，也曾经是人民的英雄。他刺杀了皇帝，让一个凶残而庞大的帝国分崩离析，新的秩序在联邦政府下建立起来。为了救赎自己犯下的过错，他不惜与昔日的战友利维坦反目，在忠诚与正义之间选择一条道路。在“魂斗罗”的世界里，英雄永远都不能停息，因此这个故事并没有因为建立起新的秩序而结束。
二十多年后的“异形战争”，成就了比尔和兰斯的“魂斗罗”称号，也让巴哈姆特上校再次成为人们口中的英雄。然而就在MD版的《魂斗罗：铁血兵团》中，我们看到了过去的英雄巴哈姆特上校出现惊人转变——他再次掀起反叛的大旗，与联邦政府做对，并且盗取了“莫伊拉遗迹”的力量，希望通过异形基因，推翻现在的政府。历史的巧合就在这里，最终击败巴哈姆特的，竟然遵从当年兵团模式而建立起来的魂斗罗四人战队——一男一女，再加一条狗和一个机器人。
如果我们将整个“魂斗罗”的历史贯穿起来，就会发现巴哈姆特与兰斯几乎走出了一样的人生轨迹，因为一样的原因而选择了一样的道路。巴哈姆特与兰斯，都是拥有匹配“魂斗罗”称号的精英战士，两人都在“异形战争”中成为备受瞩目的英雄。两个人在前后不到一年的时间内，先后背叛了联邦政府，并且都希望借助异形的基因改造自己，以对抗人类政府的统治。在两位战士的人生中，都曾站在面对昔日战友的艰难抉择之上，只是巴哈姆特杀死了战友，而兰斯被比尔杀死。那么有足够的理由相信，巴哈姆特反叛联邦政府，应该是与一年后的兰斯有着同样的原因——为了夺回“莫伊拉遗迹”。历史让两位英雄最终都黯然落幕，成为人们口中的叛徒。
